提供环境样本、肠道菌群等复杂微生物群落的宏基因组测序服务,涵盖DNA提取、文库构建、高通量测序、物种组成分析、功能基因注释与差异分析。
宏基因组学跳过了传统微生物学"先分离纯培养、再逐个研究"的环节,直接提取样本(如肠道、土壤、水体)中全部微生物的混合DNA进行测序,通过序列比对推断样本里存在哪些物种、各自的相对丰度,以及它们携带哪些功能基因,能够覆盖大量目前还无法在实验室条件下培养的微生物类群。
16S rRNA(细菌/古菌)、18S rRNA或ITS(真菌)扩增子测序只针对某一段保守又有变异的标记基因做测序,成本较低,主要用于回答"有哪些物种、比例多少";鸟枪法宏基因组测序则对样本全部DNA随机打断测序,除了物种组成外还能获得功能基因、代谢通路等更丰富的信息,但测序深度要求和成本相应更高。
微生物群落组成对采样、运输、保存条件非常敏感,采样后如果不能及时低温保存或使用专用保存液,样本里部分菌群的DNA可能发生降解或组成比例发生变化,建议采样时就按照宏基因组专用的采集/保存流程操作,而不是套用普通样本的保存方式。
对于肠道、皮肤等与宿主组织混合紧密的样本,宿主自身细胞的DNA可能会大量混入提取产物中,稀释掉微生物DNA的测序比例,必要时需要在提取阶段做宿主DNA去除处理,或在测序深度设计时预留冗余。
环境和肠道中很大一部分微生物目前还无法在实验室条件下用常规培养基分离培养(有研究估计超过90%),宏基因组测序能够绕开培养这道门槛,直接从DNA序列层面"看到"这些此前科学界难以研究的未培养微生物类群。
当你研究的对象是一个复杂的微生物群落(如肠道菌群、环境样本),而不是单一可培养菌株时,宏基因组测序能让你不经过培养分离,直接了解整个群落的物种组成和功能潜力——回答“这个环境里,到底住着哪些微生物、它们能做什么”。
直接提取样本中全部微生物DNA,无需培养分离,经高通量测序获得群落中所有物种的基因组信息;通过物种注释数据库比对分析群落物种组成,结合功能数据库(如KEGG)分析群落代谢功能潜力。
肠道菌群与疾病关联研究、环境微生态研究、益生菌功能研究等。
直接测序群落全部微生物DNA
测序深度可按需定制
群落组成与代谢功能同步呈现
肠道菌群/环境微生态均可开展
提交实验方案与目标
技术顾问确认工艺与周期
支付不低于50%项目启动款,正式排产
全流程质控留档
结清尾款,完成验收
标准订单及定制/大额订单均需支付不低于合同总额的50%作为项目启动款,剩余尾款支付时限根据具体项目另行约定。
客户收到产品或报告后,请于1个月内完成验收;如对交付结果有异议,请于此窗口期内提出,我们将在2个工作日内响应并协助处理。