提供基于液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)的蛋白质组学服务,涵盖样品前处理、酶解、色谱分离、质谱检测与数据分析,可用于全蛋白表达谱、差异蛋白筛选、翻译后修饰分析等。
主流的"鸟枪法(shotgun)"蛋白质组学不会直接对完整蛋白测序,而是先用胰蛋白酶等特异性蛋白酶将蛋白样品酶切成较短的肽段,肽段经过液相色谱分离后依次进入质谱仪电离,检测器测量每个肽段离子的质荷比(m/z)和碎裂后的二级质谱图谱,再与蛋白序列数据库比对,反推出这些肽段分别来自哪个蛋白。
无标记定量直接比较不同样本中同一肽段的离子强度或谱图计数,操作简便、成本较低,但对仪器稳定性和上机批次一致性要求较高;TMT/iTRAQ等同位素标记定量则在样品制备阶段给不同样本贴上不同的"分子标签",可以把多个样本混合后一次上机检测,定量准确性和通量通常更高,但试剂成本也相应更高。
样本中残留的高浓度盐、去污剂、核酸等杂质会干扰电喷雾电离效率,甚至污染质谱仪的离子源,建议蛋白样品在提交前充分脱盐、避免使用质谱不兼容的裂解/纯化试剂,必要时可以提前咨询确认样品制备方案是否符合质谱要求。
质谱蛋白质组学对高丰度蛋白的覆盖较好,但低丰度蛋白(如很多信号转导相关的调控蛋白)容易被高丰度蛋白的信号掩盖而难以被有效鉴定到,如果实验目标恰好是低丰度的关键调控蛋白,可能需要结合免疫富集等预富集手段提高检出概率。
同一个蛋白酶切后往往会产生多条肽段,且很多肽段序列在不同蛋白之间可能存在重叠(共有肽段),蛋白质组学软件在把肽段鉴定结果推断回"蛋白"层面时,需要用到专门的蛋白推断算法来处理这种多对多的映射关系,这也是报告里"肽段数"和"蛋白数"不是简单倍数关系的原因。
当你想从整体蛋白质水平、无偏地了解“处理前后到底哪些蛋白变了”,而不是只盯着一个已知蛋白时,质谱蛋白质组学能提供全景式的蛋白表达图谱——回答“除了我关注的那个蛋白,还有哪些蛋白也发生了变化”。
蛋白样品经酶解为肽段后,通过高效液相色谱分离,进入质谱进行一级/二级碎裂检测,依据肽段质荷比与碎裂谱图进行序列鉴定与定量,实现对成千上万种蛋白的深度覆盖分析。
差异蛋白筛选、修饰组学、互作复合物解析、标志物发现等。
成千上万种蛋白同步鉴定定量
周期视样本量与分析深度而定
含生信分析报告交付
磷酸化/糖基化等PTM分析
提交实验方案与目标
技术顾问确认工艺与周期
支付不低于50%项目启动款,正式排产
全流程质控留档
结清尾款,完成验收
标准订单及定制/大额订单均需支付不低于合同总额的50%作为项目启动款,剩余尾款支付时限根据具体项目另行约定。
客户收到产品或报告后,请于1个月内完成验收;如对交付结果有异议,请于此窗口期内提出,我们将在2个工作日内响应并协助处理。