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蛋白质组学
基于质谱的蛋白定性与定量分析

提供基于液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)的蛋白质组学服务,涵盖样品前处理、酶解、色谱分离、质谱检测与数据分析,可用于全蛋白表达谱、差异蛋白筛选、翻译后修饰分析等。

质谱怎么把肽段测出来、再拼回蛋白

核心原理
注意事项
小知识点

先把蛋白酶切成肽段,再靠质荷比(m/z)鉴定身份

主流的"鸟枪法(shotgun)"蛋白质组学不会直接对完整蛋白测序,而是先用胰蛋白酶等特异性蛋白酶将蛋白样品酶切成较短的肽段,肽段经过液相色谱分离后依次进入质谱仪电离,检测器测量每个肽段离子的质荷比(m/z)和碎裂后的二级质谱图谱,再与蛋白序列数据库比对,反推出这些肽段分别来自哪个蛋白。

定量方式分为无标记(label-free)和标记定量两大类

无标记定量直接比较不同样本中同一肽段的离子强度或谱图计数,操作简便、成本较低,但对仪器稳定性和上机批次一致性要求较高;TMT/iTRAQ等同位素标记定量则在样品制备阶段给不同样本贴上不同的"分子标签",可以把多个样本混合后一次上机检测,定量准确性和通量通常更高,但试剂成本也相应更高。

样本纯度和盐浓度会直接影响质谱信号质量

样本中残留的高浓度盐、去污剂、核酸等杂质会干扰电喷雾电离效率,甚至污染质谱仪的离子源,建议蛋白样品在提交前充分脱盐、避免使用质谱不兼容的裂解/纯化试剂,必要时可以提前咨询确认样品制备方案是否符合质谱要求。

低丰度蛋白的鉴定和定量本身存在技术上限

质谱蛋白质组学对高丰度蛋白的覆盖较好,但低丰度蛋白(如很多信号转导相关的调控蛋白)容易被高丰度蛋白的信号掩盖而难以被有效鉴定到,如果实验目标恰好是低丰度的关键调控蛋白,可能需要结合免疫富集等预富集手段提高检出概率。

质谱鉴定的"蛋白"和"肽段"数量为什么经常对不上?

同一个蛋白酶切后往往会产生多条肽段,且很多肽段序列在不同蛋白之间可能存在重叠(共有肽段),蛋白质组学软件在把肽段鉴定结果推断回"蛋白"层面时,需要用到专门的蛋白推断算法来处理这种多对多的映射关系,这也是报告里"肽段数"和"蛋白数"不是简单倍数关系的原因。

实验目的与应用场景

实验目的

当你想从整体蛋白质水平、无偏地了解“处理前后到底哪些蛋白变了”,而不是只盯着一个已知蛋白时,质谱蛋白质组学能提供全景式的蛋白表达图谱——回答“除了我关注的那个蛋白,还有哪些蛋白也发生了变化”。

应用场景

技术原理与应用方向

技术原理

蛋白样品经酶解为肽段后,通过高效液相色谱分离,进入质谱进行一级/二级碎裂检测,依据肽段质荷比与碎裂谱图进行序列鉴定与定量,实现对成千上万种蛋白的深度覆盖分析。

应用方向

差异蛋白筛选、修饰组学、互作复合物解析、标志物发现等。

服务优势

深度覆盖分析

成千上万种蛋白同步鉴定定量

按项目规模评估

周期视样本量与分析深度而定

鉴定+定量报告

含生信分析报告交付

修饰组学可选

磷酸化/糖基化等PTM分析

交付说明

按项目规模评估周期,签约时确认
交付内容:鉴定/定量数据与生信分析报告;如需修饰组学分析请提前与技术顾问沟通方案。

订购流程

1

需求沟通

提交实验方案与目标

2

方案确认

技术顾问确认工艺与周期

3

预付下单

支付不低于50%项目启动款,正式排产

4

生产质控

全流程质控留档

5

交付验收

结清尾款,完成验收

付款与验收说明

项目启动款说明

标准订单及定制/大额订单均需支付不低于合同总额的50%作为项目启动款,剩余尾款支付时限根据具体项目另行约定。

验收说明

客户收到产品或报告后,请于1个月内完成验收;如对交付结果有异议,请于此窗口期内提出,我们将在2个工作日内响应并协助处理。

免责声明:本页面所示交付周期、技术参数为常规参考区间,具体以订单确认单为准。 ↑ 返回页面顶部
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